প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং থেকে তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং পর্যন্ত:জিন সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির বিবর্তন এবং সাফল্য

জিন সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির উন্নয়নে, প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং থেকে তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং পর্যন্ত প্রতিটি পুনরাবৃত্তি উল্লেখযোগ্য পরিবর্তন এনেছে. আজ, আসুন এই তিনটি সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির মধ্যে প্রধান পার্থক্যগুলি বিস্তারিতভাবে দেখি.

1. প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং: ক্লাসিক সেঙ্গার সিকোয়েন্সিং

নীতি ও পদ্ধতি

প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং, স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং নামেও পরিচিত, প্রাচীনতম ডিএনএ সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি. এর মূল নীতি হল চেইন টার্মিনেশন পদ্ধতি, যার মধ্যে ddNTPs প্রবর্তন জড়িত(dideoxynucleotides) ডিএনএ সংশ্লেষণ প্রক্রিয়া চলাকালীন বিভিন্ন ফ্লুরোসেন্ট মার্কার দিয়ে লেবেলযুক্ত চেইনটির সম্প্রসারণ বন্ধ করতে, যার ফলে ডিএনএ ক্রম নির্ধারণ করা হয়. যদিও এই পদ্ধতিটি সুনির্দিষ্ট, এটি একটি কম থ্রুপুট আছে, একটি সময়ে শুধুমাত্র একটি ডিএনএ খণ্ডের ক্রমানুসারে.

• সুবিধা এবং অসুবিধা

সুবিধা: দীর্ঘ সিকোয়েন্সিং দৈর্ঘ্য, পর্যন্ত 1000 bp; খরচ কার্যকর এবং দ্রুত পরিবর্তন, কম-থ্রুপুট নমুনা গবেষণার জন্য উপযুক্ত; তুলনামূলকভাবে কম উপকরণ খরচ; DNA সিকোয়েন্সের 800 bp এর মধ্যে সঠিকভাবে বেস বৈচিত্র্য সনাক্ত করতে সক্ষম; উচ্চ নির্ভুলতা, একটি সূক্ষ্ম প্রক্রিয়া এবং একাধিক গুণমান নিয়ন্ত্রণ পদক্ষেপ সহ, এটিকে দূষণের ঝুঁকি কম করে এবং দৃশ্যত স্বজ্ঞাত সিকোয়েন্সিং ফলাফল প্রদান করে.

অসুবিধা: কম সিকোয়েন্সিং থ্রুপুট, প্রতি প্রতিক্রিয়া প্রাপ্ত শুধুমাত্র একটি ক্রম সঙ্গে; বড় আকারের সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য অপেক্ষাকৃত উচ্চ খরচ; উচ্চ GC এবং পুনরাবৃত্তিমূলক ক্রম অঞ্চল সনাক্ত করতে অসুবিধা; বড় খণ্ড মুছে ফেলা এবং কপি নম্বর বৈচিত্র্য সনাক্ত করতে অক্ষমতা, অন্যান্য ধরনের জিন মিউটেশনের মধ্যে.

• আবেদন

জৈবিক গবেষণায় প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের বিস্তৃত পরিসর রয়েছে, যেমন জিনোমিক্স, প্রোটিওমিক্স, রোগ গবেষণা, প্রজাতি সনাক্তকরণ, এবং পদ্ধতিগত বিবর্তন অধ্যয়ন, পাশাপাশি জনসংখ্যার জেনেটিক্স. উপরন্তু, উচ্চ নির্ভুলতা এবং কম মিথ্যা-ইতিবাচক হারের কারণে, এটি এখনও জিন সনাক্তকরণের জন্য সোনার মান হিসাবে বিবেচিত হয়.

2. দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং: হাই-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের উত্থান

• নীতি ও পদ্ধতি

দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং, উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং নামেও পরিচিত, চারপাশে আবির্ভূত 2005. এর মূল নীতিতে একাধিক ডিএনএ খণ্ডের সমান্তরাল অনুক্রম জড়িত, যা একটি নির্দিষ্ট পদ্ধতির মাধ্যমে নির্দিষ্ট অবস্থানের সাথে সংযুক্ত(যেমন কঠিন-ফেজ সমর্থন বা মাইক্রোবিডস). তারপর সিকোয়েন্সিং-বাই-সিনথেসিস পদ্ধতি ব্যবহার করে সিকোয়েন্সগুলি সিঙ্ক্রোনাসভাবে পড়া হয়. প্রবর্তিত প্রতিটি বেস একটি সনাক্তযোগ্য সংকেত তৈরি করে, এবং বিপুল সংখ্যক সমান্তরাল সংকেত সংগ্রহ এবং প্রক্রিয়াকরণের মাধ্যমে, সম্পূর্ণ ক্রম তথ্য একত্রিত করা হয়. সাধারণ দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মের মধ্যে রয়েছে ইলুমিনা, 454 সিকোয়েন্সিং, এবং আয়ন টরেন্ট সিকোয়েন্সিং.

• সুবিধা এবং অসুবিধা

সুবিধা: উচ্চ থ্রুপুট, অল্প সময়ের মধ্যে বড় আকারের জিনোম সিকোয়েন্সিং সম্পন্ন করতে সক্ষম; খরচ কার্যকর, প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং সহ কয়েক মিলিয়ন ডলার থেকে সম্পূর্ণ মানব জিনোম সিকোয়েন্সিংয়ের খরচ হাজার হাজার ডলারে হ্রাস করা, এবং সিকোয়েন্সিং সময়কে বছর থেকে সপ্তাহ বা এমনকি দিনে ছোট করা.

অসুবিধা: ছোট পড়ার দৈর্ঘ্য, সাধারণত মধ্যে 100 এবং 300 bp, যা কিছু জটিল জিনোমিক অঞ্চলের সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য আদর্শ নয়(যেমন পুনরাবৃত্তিমূলক ক্রম বা অনেক কাঠামোগত বৈচিত্র সহ অঞ্চল).

• আবেদন

দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের ব্যাপক প্রয়োগ ব্যক্তিগতকৃত ওষুধের বিকাশকে চালিত করেছে, ক্যান্সার জিনোমিক্স, এবং জিনোম সম্পাদনা. রোগ প্রতিরোধে এর প্রয়োগ, রোগ নির্ণয়, এবং চিকিত্সা ক্রমবর্ধমান ব্যাপক হয়ে উঠছে, বিশেষ করে টিউমারের ক্ষেত্রে, জেনেটিক রোগ, এবং প্রসবপূর্ব স্ক্রীনিং, যেখানে এটি একটি গুরুত্বপূর্ণ ডায়াগনস্টিক টুল হয়ে উঠেছে.

3. তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং: লং-রিড এবং সিঙ্গেল-মলিকিউল সিকোয়েন্সিং-এ ব্রেকথ্রু

• নীতি ও পদ্ধতি

তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, একক-অণু রিয়েল-টাইম দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করে(এসএমআরটি) সিকোয়েন্সিং এবং ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং, দ্বিতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের স্বল্প-পঠন-দৈর্ঘ্যের সীমাবদ্ধতাগুলি অতিক্রম করেছে এবং দীর্ঘ-পড়ার ক্ষমতা প্রদান করতে পারে, জটিল জিনোমিক অঞ্চলগুলিকে পার্স করার ক্ষমতা উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি করে.

একক-অণু রিয়েল-টাইম(এসএমআরটি) সিকোয়েন্সিং: প্যাসিফিক বায়োসায়েন্সেস দ্বারা উন্নত(প্যাকবিও), এই পদ্ধতিটি রিয়েল-টাইম সিকোয়েন্সিং অর্জনের জন্য একটি ন্যানোস্কেল ছিদ্রে একটি একক ডিএনএ অণুর সংশ্লেষণ প্রক্রিয়া সনাক্ত করে. প্রতিটি বেসের সংযোজন একটি নির্দিষ্ট ফ্লুরোসেন্ট সংকেত প্রকাশ করে, এবং রিয়েল টাইমে এই সংকেতগুলি ক্যাপচার করে, গবেষকরা ক্রমাগত ক্রম হাজার হাজার বা এমনকি কয়েক হাজার বেস পেতে পারেন.

ন্যানোপুর সিকোয়েন্সিং: অক্সফোর্ড ন্যানোপুর টেকনোলজিস দ্বারা বিকাশিত, এই পদ্ধতিটি ন্যানোস্কেল জৈবিক ছিদ্র ব্যবহার করে. যেহেতু ডিএনএ অণুগুলি একে একে ছিদ্রগুলির মধ্য দিয়ে টানা হয়, তারা ঘটায় বর্তমান পরিবর্তন পরিমাপ করা হয়. বিভিন্ন ঘাঁটি বিভিন্ন বর্তমান সংকেত উত্পাদন করে, এইভাবে ক্রম পাঠোদ্ধার করা. ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিংয়ের একটি উল্লেখযোগ্য সুবিধা হল অত্যন্ত দীর্ঘ ডিএনএ খণ্ড পড়ার ক্ষমতা, সম্ভাব্য সমগ্র ক্রোমোজোম কভার করে.

• সুবিধা এবং অসুবিধা

সুবিধা: দীর্ঘ পড়ার ক্ষমতা, ক্রমাগত ক্রমানুসারে কয়েক হাজার বা এমনকি কয়েক হাজার বেস পড়তে সক্ষম, জটিল জিনোম পার্স করার ক্ষমতা ব্যাপকভাবে উন্নত করে;একক-অণু সিকোয়েন্সিং, পিসিআর পরিবর্ধনের প্রয়োজনীয়তা দূর করা এবং প্রশস্তকরণ প্রক্রিয়ার সময় ঘটতে পারে এমন পক্ষপাত ও ত্রুটিগুলি এড়ানো; রিয়েল-টাইম সিকোয়েন্সিং, ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং সহ দ্রুত এবং রিয়েল-টাইম বৈশিষ্ট্য প্রদান করে, সিকোয়েন্সিং প্রক্রিয়া চলাকালীন যেকোনো সময় ডেটা প্রাপ্ত করার অনুমতি দেয়, যা দ্রুত রোগ নির্ণয় এবং জরুরী জৈবিক প্রয়োগের জন্য তাৎপর্যপূর্ণ.

অসুবিধা: যথার্থতা দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের থেকে সামান্য নিকৃষ্ট, এবং খরচ তুলনামূলকভাবে বেশি. তবে, ক্রমাগত প্রযুক্তিগত অগ্রগতি সঙ্গে, তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের যথার্থতা ধীরে ধীরে উন্নত হচ্ছে.

• আবেদন

তৃতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং স্ট্রাকচারাল ভ্যারিয়েশন ডিটেকশনে উৎকৃষ্ট, সম্পূর্ণ-জিনোম সমাবেশ, এবং ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, জিনোমিক গবেষণার সীমানা আরও প্রসারিত করা.

প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং থেকে তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং পর্যন্ত, জিন সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির প্রতিটি অগ্রগতি জীবন বিজ্ঞান এবং চিকিৎসা গবেষণায় নতুন সুযোগ নিয়ে এসেছে. যদিও প্রথম প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং সুনির্দিষ্ট কিন্তু থ্রুপুটে সীমিত, দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং, এর উচ্চ থ্রুপুট এবং কম খরচে, বর্তমান মূলধারার প্রযুক্তি হয়ে উঠেছে. তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং, এর দীর্ঘ-পঠিত এবং একক-অণু সিকোয়েন্সিং ক্ষমতার মাধ্যমে, আগের দুই প্রজন্মের শূন্যস্থান পূরণ করে, জটিল জিনোম অধ্যয়নের জন্য নতুন সরঞ্জাম প্রদান. প্রযুক্তির পুনরাবৃত্তি এবং অগ্রগতি অব্যাহত, ওষুধের মতো ক্ষেত্রে জিন সিকোয়েন্সিংয়ের প্রয়োগের সম্ভাবনা, কৃষি, এবং বাস্তুশাস্ত্র ক্রমবর্ধমান বিস্তৃত হচ্ছে.

সরবরাহকারী

সাংহাই লিংজুন বায়োটেকনোলজি কো., লিমিটেডসালে প্রতিষ্ঠিত হয় 2016 যা বায়োম্যাগনেটিক উপকরণ এবং নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন বিকারকগুলির একটি পেশাদার প্রস্তুতকারক.

আমাদের নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন এবং পরিশোধন সমৃদ্ধ অভিজ্ঞতা আছে, প্রোটিন পরিশোধন, কোষ বিচ্ছেদ, কেমিলুমিনেসেন্স, এবং অন্যান্য প্রযুক্তিগত ক্ষেত্র.

আমাদের পণ্য ব্যাপকভাবে অনেক ক্ষেত্রে ব্যবহৃত হয়, যেমন মেডিকেল টেস্টিং, জেনেটিক পরীক্ষা, বিশ্ববিদ্যালয় গবেষণা, জেনেটিক প্রজনন, এবং তাই. আমরা কেবল পণ্য সরবরাহ করি না তবে OEM গ্রহণ করতে পারি, ওডিএম, এবং অন্যান্য প্রয়োজন. আপনি যদি একটি সম্পর্কিত প্রয়োজন আছে, আমাদের সাথে যোগাযোগ বিনা দ্বিধায় দয়া করে .