Hvorfor bruger flere og flere universitetslærere den magnetiske perlemetode i stedet for den traditionelle?

I de senere år, magnetisk perle-baseret nukleinsyreekstraktionsteknologi er hurtigt blevet populært på universiteter og forskningsinstitutioner, gradvist at erstatte de traditionelle phenol-chloroform-ekstraktions- og centrifugalsøjlemetoder. Dette tilskrives hovedsageligt dens høje effektivitet, potentiale for automatisering, sikkerhed, og tilpasningsevne til komplekse prøver. Det følgende er den specifikke analyse af årsagerne:

1. Nem at betjene og kompatibel med automatisering med høj kapacitet

Smertepunkter ved traditionelle metoder

Phenol-chloroform metode: Det kræver flere centrifugeringer og faseadskillelser, er besværlig at betjene og udsat for forurening.

Centrifugal kolonne metode: Det involverer mange manuelle trin (såsom lysis, kolonnepassering, vask, osv.) og har en lav gennemstrømning.

Fordele ved den magnetiske perlemetode

Efter at de magnetiske perler binder sig til nukleinsyrer, de kan hurtigt adskilles gennem et magnetfelt (uden behov for centrifugering) og direkte integreret i en 96-brønds pladeautomatiseret platform, som er velegnet til storskala prøvebehandling (såsom epidemiologisk screening og omics-forskning).

Sag: Under COVID-19-pandemien, den magnetiske perlemetode blev det foretrukne valg til nukleinsyretest med høj kapacitet.

2. Højere ekstraktionseffektivitet og renhed

Stærk bindingsspecificitet

Siliciumbaserede magnetiske perler adsorberer selektivt nukleinsyrer under betingelser med højt saltindhold, reducere protein- og polysaccharidkontamination (den traditionelle phenol-chloroform-metode er tilbøjelig til resterende organiske opløsningsmidler, og centrifugalsøjlemetoden er tilbøjelig til tilstopning).

Høj genvindingsgrad

Magnetiske perler har et stort overfladeareal, og deres indfangningseffektivitet for små DNA/RNA-fragmenter og lavkoncentrationsprøver er overlegen i forhold til centrifugalsøjler (f.eks, genvindingshastigheden af ​​cfDNA-ekstraktion øges med 20% til 30%).

Dataunderstøttelse

Litteratur rapporterer, at A260/A230-forholdet mellem plante-RNA ekstraheret ved magnetisk perlemetode generelt er større end 2.0, mens den traditionelle metode ofte fører til et forhold på mindre end 1.5 på grund af polysacchariderester.

3. Bredere prøveanvendelse

Mulighed for kompleks prøvebehandling

Den magnetiske perlemetode kan tilpasses til prøver, der er svære at udtrække, såsom plantevæv, afføring, jord, og FFPE sektioner ved at justere bufferopløsningen (såsom tilføjelse af CTAB eller PVPP), mens centrifugalsøjlemetoden er tilbøjelig til tilstopning.

Reager fleksibelt på sporprøver

Magnetiske perler kan binde sig til spormængder af nukleinsyrer (såsom Pg-niveau DNA i enkeltcelle sekventering), men tabsraten for traditionelle metoder er høj.

4. Sikkerheds- og miljøbeskyttelsesfordele

Undgå giftige reagenser

Den magnetiske perlemetode kræver ikke kræftfremkaldende stoffer som phenol og chloroform, at reducere sundhedsrisici for laboratoriepersonale.

Reducer plastikaffald

Centrifugalsøjlemetoden bruger en stor mængde plastikforbrugsvarer, mens den magnetiske perlemetode kan genbruge magnetiske perler (f.eks, nogle modeller kan genbruges 35 gange), hvilket er mere miljøvenligt.

5. Optimering af cost-benefit ratio

Høj startomkostning, mere økonomisk på lang sigt

Selvom enhedsprisen på magnetiske perlereagenser er høj, automatisering kan reducere lønomkostningerne og er især velegnet til store projekter.

Universitetssag: Et laboratoriums sammenligning viste, at ved forarbejdning 1,000 prøver, de samlede omkostninger ved den magnetiske perlemetode var 15% til 20% lavere end ved centrifugalsøjlemetoden.

Acceleration af indenlandsk substitution

Indenlandske magnetiske perler (såsom Nanomicro og Borui) have ydeevne tæt på importerede mærker, men deres priser er kun 1/3 til 1/2, som fremmer deres popularisering.

6. Teknologiintegration og banebrydende applikationer

Kompatibel molekylær diagnostisk teknologi

Nukleinsyrerne ekstraheret ved den magnetiske perlemetode kan bruges direkte til qPCR, NGS- og CRISPR-detektion uden yderligere oprensning.

Efterspørgsel på nye områder

Enkeltcelle sekventering, flydende biopsi (ctDNA), og andre metoder, der kræver nukleinsyrer med høj renhed, den magnetiske perlemetode er det almindelige valg.

Udvælgelseslogikken for universiteter/forskningsinstitutioner

1. Effektivitetsdrevet: Arbejdsomkostningerne for postgraduate studerende er høje, og automatisering frigør arbejdskraft.

2. Krav til datakvalitet: High-throughput-sekventering og andre metoder kræver nukleinsyrer med høj renhed, og den magnetiske perlemetode er mere pålidelig.

3. Sikkerhed og overholdelse: EHS (Miljøsundhed og sikkerhed) ledelsen på gymnasier og universiteter bliver strengere, og phenoliske reagenser udfases.

Fremtidige tendenser

Overflademodifikationen af ​​magnetiske perler er forskelligartet: såsom EPCAM-modificerede magnetiske perler, der er egnede til exosomekstraktion.

Mikrofluidisk integration: Kombinationen af ​​magnetisk perlemetode og Lab-on-a-chip for at opnå “prøve i, resultat ud”.

Magnetisk perlemetode, med dens karakteristika ved “sikkerhed, effektivitet og fleksibilitet”, er blevet det almindelige valg til nukleinsyreekstraktion. Især i forbindelse med efterspørgslen efter komplekse prøver og høj gennemstrømning i videnskabelige forskningsscenarier, det er uundgåeligt at erstatte traditionelle metoder.

Leverandør

Shanghai Lingjun Biotechnology Co., Ltd.blev etableret i 2016 som er en professionel producent af biomagnetiske materialer og nukleinsyreekstraktionsreagenser.

Vi har stor erfaring med udvinding og oprensning af nukleinsyre, proteinoprensning, celleadskillelse, kemiluminescens, og andre tekniske områder.

Vores produkter er meget udbredt inden for mange områder, såsom medicinsk test, genetisk testning, universitetsforskning, genetisk avl, og så videre. Vi leverer ikke kun produkter, men kan også påtage os OEM, ODM, og andre behov. Hvis du har et relateret behov, er du velkommen til at kontakte os .