Hvorfor bruker flere og flere høyskolelærere den magnetiske perlemetoden i stedet for den tradisjonelle?

De siste årene, magnetisk perlebasert nukleinsyreekstraksjonsteknologi har blitt raskt popularisert på universiteter og forskningsinstitusjoner, gradvis erstatte de tradisjonelle fenol-kloroform-ekstraksjons- og sentrifugalkolonnemetodene. Dette skyldes hovedsakelig den høye effektiviteten, potensial for automatisering, sikkerhet, og tilpasningsevne til komplekse prøver. Følgende er den spesifikke analysen av årsakene:

1. Enkel å betjene og kompatibel med automatisering med høy gjennomstrømning

Smertepunkter av tradisjonelle metoder

Fenol-kloroform metode: Det krever flere sentrifugeringer og faseseparasjoner, er tungvint å betjene og utsatt for forurensning.

Sentrifugalkolonnemetode: Det innebærer mange manuelle trinn (som lysis, kolonnepassering, vask, osv.) og har lav gjennomstrømning.

Fordeler med den magnetiske perlemetoden

Etter at de magnetiske perlene binder seg til nukleinsyrer, de kan raskt separeres gjennom et magnetfelt (uten behov for sentrifugering) og direkte integrert i en 96-brønners plateautomatisert plattform, som er egnet for storskala prøvebehandling (som epidemiologisk screening og omics-forskning).

Sak: Under COVID-19-pandemien, den magnetiske perlemetoden ble det foretrukne valget for testing av nukleinsyrer med høy gjennomstrømning.

2. Høyere ekstraksjonseffektivitet og renhet

Sterk bindingsspesifisitet

Silisiumbaserte magnetiske perler adsorberer selektivt nukleinsyrer under høye saltforhold, redusere protein- og polysakkaridforurensning (den tradisjonelle fenol-kloroform-metoden er utsatt for gjenværende organiske løsemidler, og sentrifugalkolonnemetoden er utsatt for tilstopping).

Høy utvinningsgrad

Magnetiske perler har et stort overflateareal, og deres fangsteffektivitet for små DNA/RNA-fragmenter og lavkonsentrasjonsprøver er overlegen den for sentrifugalkolonner (for eksempel, utvinningshastigheten for cfDNA-ekstraksjon økes med 20% til 30%).

Datastøtte

Litteratur rapporterer at A260/A230-forholdet mellom plante-RNA ekstrahert ved magnetisk perlemetode generelt er større enn 2.0, mens den tradisjonelle metoden ofte fører til et forhold på mindre enn 1.5 på grunn av polysakkaridrester.

3. Bredere prøveanvendelse

Komplisert prøvebehandlingsevne

Den magnetiske perlemetoden kan tilpasses vanskelige å trekke ut prøver som plantevev, avføring, jord, og FFPE-seksjoner ved å justere bufferløsningen (som å legge til CTAB eller PVPP), mens sentrifugalkolonnemetoden er utsatt for tilstopping.

Reager fleksibelt på sporprøver

Magnetiske kuler kan binde seg til spormengder av nukleinsyrer (slik som Pg-nivå DNA i enkeltcellesekvensering), men tapsraten for tradisjonelle metoder er høy.

4. Fordeler med sikkerhet og miljøvern

Unngå giftige reagenser

Den magnetiske perlemetoden krever ikke kreftfremkallende stoffer som fenol og kloroform, redusere helserisikoen for laboratoriepersonell.

Reduser plastavfallet

Sentrifugalkolonnemetoden bruker en stor mengde plastforbruksvarer, mens den magnetiske perlemetoden kan gjenbruke magnetiske perler (for eksempel, noen modeller kan resirkuleres 35 ganger), som er mer miljøvennlig.

5. Optimalisering av nytte-kostnadsforhold

Høy startkostnad, mer økonomisk på lang sikt

Selv om enhetsprisen på magnetiske perlereagenser er høy, automatisering kan redusere arbeidskostnadene og er spesielt egnet for store prosjekter.

Universitetssak: Et laboratoriums sammenligning fant det ved behandling 1,000 prøver, den totale kostnaden for den magnetiske perlemetoden var 15% til 20% lavere enn for sentrifugalkolonnemetoden.

Akselerasjon av innenlandsk substitusjon

Innenlandske magnetiske perler (som Nanomicro og Borui) ha ytelse nær importerte merker, men prisene deres er bare 1/3 til 1/2, som fremmer deres popularisering.

6. Teknologiintegrasjon og banebrytende applikasjoner

Kompatibel molekylær diagnostisk teknologi

Nukleinsyrene ekstrahert med magnetisk perlemetoden kan brukes direkte til qPCR, NGS- og CRISPR-deteksjon uten ytterligere rensing.

Etterspørsel i nye felt

Enkeltcellesekvensering, flytende biopsi (ctDNA), og andre metoder som krever nukleinsyrer med høy renhet, den magnetiske perlemetoden er det vanlige valget.

Utvelgelseslogikken til universiteter/forskningsinstitusjoner

1. Effektivitetsdrevet: Arbeidskostnadene for doktorgradsstudenter er høye, og automatisering frigjør arbeidskraft.

2. Krav til datakvalitet: Sekvensering med høy gjennomstrømning og andre metoder krever nukleinsyrer med høy renhet, og den magnetiske perlemetoden er mer pålitelig.

3. Sikkerhet og samsvar: EHS (Miljøhelse og sikkerhet) ledelsen i høyskoler og universiteter blir strengere, og fenoliske reagenser fases ut.

Fremtidige trender

Overflatemodifiseringen av magnetiske perler er mangfoldig: slik som EPCAM-modifiserte magnetiske perler egnet for eksosomekstraksjon.

Mikrofluidisk integrasjon: Kombinasjonen av magnetisk perlemetode og Lab-on-a-chip for å oppnå “prøve inn, resultat ut”.

Magnetisk perlemetode, med sine egenskaper ved “sikkerhet, effektivitet og fleksibilitet”, har blitt hovedvalget for nukleinsyreekstraksjon. Spesielt i sammenheng med etterspørselen etter komplekse prøver og høy gjennomstrømning i vitenskapelige forskningsscenarier, det er uunngåelig å erstatte tradisjonelle metoder.

Leverandør

Shanghai Lingjun Biotechnology Co., Ltd.ble etablert i 2016 som er en profesjonell produsent av biomagnetiske materialer og nukleinsyreekstraksjonsreagenser.

Vi har rik erfaring innen utvinning og rensing av nukleinsyre, proteinrensing, celleseparasjon, kjemiluminescens, og andre tekniske felt.

Våre produkter er mye brukt på mange felt, som medisinsk testing, genetisk testing, universitetsforskning, genetisk avl, og så videre. Vi leverer ikke bare produkter, men kan også påta oss OEM, ODM, og andre behov. Hvis du har et relatert behov, ta gjerne kontakt med oss .