Применение и перспективы магнитных шариковых методов при экстракции геномной ДНК из полисахарида- и растения, богатые полифенолами

Предисловие

Сегодня, мы углубимся в применение и перспективы методы экстракции геномной ДНК из полисахарида на основе магнитных шариков- и растения, богатые полифенолами. Это очень популярная, но сложная сфера., а появление технологии магнитных шариков значительно улучшило извлечение ДНК из таких “трудный” образцы растений.

1. Проблемы традиционных методов

Полисахарид- и растения, богатые полифенолами (например, чайные листья, клубника, помидоры, тополя, и грецкие орехи) уже давно создают трудности в исследованиях молекулярной биологии. К основным проблемам относятся:

• Полисахариды: Совместное осаждение с ДНК, образуя вязкие гелеобразные вещества, которые ингибируют последующие реакции, такие как ферментативное расщепление, ПЦР, и секвенирование.
• Полифенолы: Легко окисляется в хиноны при экстракции., которые необратимо связываются с ДНК, превращая его в коричневый разложившийся материал и серьезно влияя на чистоту и качество ДНК..
• Вторичные метаболиты: Другие вторичные метаболиты также ингибируют последующие применения..
• Традиционный метод CTAB: Хоть и оптимизирован с годами, это включает в себя шаги, отнимает много времени, и во многом зависит от токсичных органических реагентов. (например, хлороформ), что делает его неэффективным для приложений с высокой пропускной способностью и автоматизации..

2. Конкретные стратегии применения методов на основе магнитных шариков

Для решения уникальных проблем полисахаридов- и растения, богатые полифенолами, Для экстракции нуклеиновых кислот на основе магнитных шариков обычно используются следующие оптимизированные стратегии::

2.1 Улучшенный лизисный буфер:

Высокие концентрации ЦТАБ/ДСН: Обеспечить полный лизис клеток и денатурацию белка..

2.2 Высокие концентрации восстановителей:

β-меркаптоэтанол (2%–4%) или более эффективный DTT (дитиотреитол) необходимы для предотвращения окисления полифенолов.

Полимерные добавки: Поливинилпирролидон (ПВП) или нерастворимый ПВП (ПВПП) преимущественно связываются с полифенолами, образуя нерастворимые комплексы, которые можно удалить центрифугированием., предотвращение вмешательства в последующие шаги.

Высокая концентрация соли: NaCl помогает удалить полисахариды и способствует лучшему связыванию ДНК с магнитными шариками..

Оптимизированные условия связывания:

Точно контролируйте pH и концентрацию соли в буфере для связывания, чтобы создать среду, благоприятствующую связыванию ДНК, а не связыванию примесей..

2.3 Тщательная стирка:

Дополнительные этапы промывки или использование промывочных буферов, содержащих этанол и гидрохлорид гуанидина, более тщательно удаляют остаточные полисахариды и соли..

2.4 Выбор магнитных бусин:

Магнитные бусины разных размеров., модификации поверхности, и концентрации различаются по связывающей способности и специфичности.. Выбор гранул подходящего размера имеет решающее значение для работы с большими фрагментами геномной ДНК растений..

3. Перспективы применения и будущие направления

Перспективы магнитных шариковых методов экстракции ДНК из полисахарида- Растения, богатые полифенолами, широко распространены,В основном это отражается в следующих аспектах.:

3.1 Основная движущая сила высокопроизводительных исследований в области геномики:

Селекция сельскохозяйственных культур вступает в эпоху геномной селекции, генотипирование тысяч людей (например, используя ГБС, ССР, изменение последовательности, Анализ чипа SNP) требует высокопроизводительной автоматизации, что делает методы на основе магнитных шариков идеальным выбором для предварительной обработки.

3.2 Идеальная совместимость с технологиями секвенирования третьего поколения.:

Давно читаемые технологии секвенирования (например, ПакБио СМЕРТЬ, Оксфорд Нанопор) требуют высокой честности, высокомолекулярный (ХМВ) ДНК. Оптимизированные методы на основе магнитных шариков эффективно извлекают высококачественные (штаб-квартира) ДНК HMW, удовлетворение требований к подготовке библиотеки для долгосчитываемого секвенирования и возможность анализа сложных геномов растений.

3.3 Быстрое обнаружение на местах (Тестирование на месте оказания медицинской помощи):

В сочетании с портативными экстракторами нуклеиновых кислот и приборами для количественной ПЦР., методы на основе магнитных шариков могут использоваться для быстрой диагностики болезней растений в полевых условиях. (например, патогены, вирусы), идентификация генетически модифицированных культур на месте, и полевые исследования генетических ресурсов находящихся под угрозой исчезновения или редких растений..

3.4 Стандартизация и коммерциализация наборов:

Более доступные в продаже наборы на основе магнитных шариков, оптимизированные для конкретных типов растений. (например, рис, лесные деревья, лекарственные травы) появится, содействие методологической стандартизации и повышению сопоставимости результатов разных лабораторий.

4. Заключение

Методы на основе магнитных шариков, с их эффективным удалением ингибиторов, простота, и совместимость с автоматизацией, произвели революцию в экстракции геномной ДНК из полисахарида- и растения, богатые полифенолами. Они успешно устраняют узкие места традиционных методов и предоставляют высококачественную ДНК для расширенного молекулярно-биологического анализа..

С бурным развитием точного земледелия, функциональная геномика, и синтетическая биология, спрос на высококачественную растительную ДНК будет только расти. Методы на основе магнитных шариков не только незаменимы сегодня, но и будут продолжать интегрироваться в эти передовые области., вывод исследований в области науки о растениях на новую высоту.

Шанхайская биотехнологическая компания Линцзюнь., ООО. предлагает магнитные шарики для выделения геномной ДНК из полисахарида- и растения, богатые полифенолами, такой как 160014 и 160024 магнитные бусины. Эти продукты обладают более высокой способностью связывания нуклеиновых кислот., более высокая устойчивость к вмешательству ингибиторов, и отличная биосовместимость, что делает их идеальными для извлечения геномной ДНК из таких растений..

Вы можете выбрать наиболее подходящие магнитные шарики в соответствии с вашими экспериментальными требованиями.. Мы стремимся предоставить вам продукцию высочайшего качества и эффективную, надежные услуги. Наша профессиональная команда всегда готова поддержать вас. Мы надеемся на успешное сотрудничество с вами.

Поставщик

Шанхайская биотехнологическая компания Линцзюнь., ОООбыл создан в 2016 который является профессиональным производителем биомагнитных материалов и реагентов для экстракции нуклеиновых кислот..

Мы имеем богатый опыт в экстракции и очистке нуклеиновых кислот., очистка белка, разделение клеток, хемилюминесценция, и другие технические области.

Наша продукция широко используется во многих областях., например, медицинское тестирование, генетическое тестирование, университетские исследования, генетическое разведение, и так далее. Мы не только поставляем продукцию, но и можем взять на себя OEM, ОДМ, и другие потребности. Если у вас есть соответствующая потребность, пожалуйста, не стесняйтесь обращаться к нам .