Conas a dhéantar Teicneolaíocht Roghnúcháin Mhórscála DNA i Seicheamhú NGS

Tá ról ríthábhachtach ag teicneolaíocht roghnúcháin blúirí DNA mór i seicheamhú NGS, go háirithe maidir le hathróga struchtúracha a bhrath, tionól genome, agus anailís haplotype. Seo thíos a phríomhfheidhmchláir agus a phrionsabail theicniúla:：

mé. Cásanna Iarratais

Leagan Struchtúrtha (SV) Brath

Dúshlán: Seicheamh gearrléamh traidisiúnta (e.g., Illumina) ag streachailt le leagan cruinn a ghabháil >1 kb (cuir isteach, scriostaí, inversions, trasshuímh).

Réiteach: Trí blúirí móra DNA a roghnú (10–50 kb) le haghaidh tógála leabharlainne, in éineacht le seicheamhú fadléithe (PacBio/Nanópóir) nó anailís léite nasctha, is féidir SVanna casta a chuimsíonn réigiúin athchleachtacha a réiteach.

Sampla: Imeachtaí comhleá i géanóim ailse (e.g., *ALK- EML4*) go minic a cheangal ar mhór-roinn sonraí.

Tionól Géanóim Ardchaighdeáin

Dúshlán: Is minic go mbíonn earráidí tionóil i réigiúin athchleachtach mar thoradh ar shonraí gearrléite, is cúis le ilroinnt genome.

Réiteach: Blúirí móra (e.g., Leabharlanna Fosmid) nasc fisiciúil fadraoin a sholáthar, cóimeáil scafall leanúnach a chumasú (5–10× feabhas ar N50).

Sampla: Líon Cuibhreannas T2T an cluiche ceannais 8% bearna sa genome tagartha daonna ag baint úsáide as Hi-C agus teicneolaíochtaí ultra-fada-léamh.

Céimniú Haplotype

Dúshlán: Teipeann ar sheicheamhú gearr-léite an nasc aileileach ag suíomhanna heitrisigeacha a chaomhnú.

Réiteach: Teicneolaíochtaí bunaithe ar bharrachód (e.g., 10X Géanómaíocht) bloic haplotype a athchruthú thar na céadta kb.

Luach: Tá sé ríthábhachtach maidir le HLA a chlóscríobh agus naisc ghéine is cúis le galair a aithint.

II. Teicneolaíochtaí Roghnúcháin Croí

1. Modhanna Scartha Fisiceach

Leictreafóiréis Glóthach Réimse Pulse (PFGE): Scarann ​​blúirí >50 kb le haghaidh scagadh sampla metagenomic nó casta.

Roghnú Bead Maighnéadach (SPRIroghnaigh): Aisghabhann méideanna sonracha blúirí (e.g., 0.1–10 kb nó >15 kb) trí chóimheasa bead-go-sampla a choigeartú.

2. Saibhriú Barachóid-Bhunaithe

10X Géanóm Cróimiam: Cuimsíonn sé blúirí DNA i braoiníní ola, ag lipéadú léamha gearra ón blúire mór céanna le barrachóid.

TELL-Seq/Léamh Nasctha: Úsáideann microfluidics le haghaidh atógáil ilroinnt fhada fíorúil ag 50% costas níos ísle ná 10X.

3. Aimpliú Ciorclach-Bhunaithe

Géanómaíocht Lúb: Déantar blúirí DNA a chiorclú agus a aimpliú trí mhacasamhlú ciorcail rollta, cóngaracht fhisiciúil a chaomhnú d'ardáin chaighdeánacha NGS.

III. Buntáistí vs. Modhanna Gnáth

IV. Dúshláin agus Optamú

Ardchaighdeán DNA de dhíth: DNA slán de dhíth (DV200 >50%), ar neamhréir le samplaí FFPE a Fhorbairt feisteáin eastósctha le damáiste íseal.

Rialú Costas: Tá seicheamhú fadléithe fós costasach do straitéisí Hibride (e.g., Nasc-Léamh agus Illumina) costais a laghdú.

Uasghráduithe Bithfhaisnéisíochta: Uirlisí speisialaithe de dhíth (e.g., Canu le haghaidh tionóil, HapCUT2 le haghaidh céimniú).

V. Iarratais Ionadaithe

Rianú COVID-19: Seicheamhú nanapór agus roghnú coirníní maighnéadacha (>20 blúirí kb) réitíodh go tapa géanóim SARS-CoV-2 agus imeachtaí athcheangail.

Diagnóis Galar Géiniteach: 10X Géanómaíocht aimsithe SMN1 exon 7 scriostaí, trasnaíocht ó SMN2 a sheachaint.

Géanómaíocht Plandaí: I tionól genome eorna, Leabharlanna BAC (40–100 kb) méadaithe Contig N50 go 486 kb.

Conclúid

Sáraíonn roghnú blúirí DNA móra na teorainneacha a bhaineann le NGS gearr-léite trí chomhthéacs géanóm fadraoin a sholáthar. Le dul chun cinn i mbarrachóid (e.g., TELL-Seq) agus ardáin logánta (e.g., MGI CoolMPS), luasóidh an teicneolaíocht seo feidhmchláir i ndiagnóisic chliniciúil, staidéir éabhlóideacha, agus pórú cruinneas.

Soláthraí

Shanghai Lingjun Biteicneolaíocht Co., Teo.bunaíodh i 2016 atá ina mhonaróir gairmiúil d'ábhair bithmhaighnéadacha agus imoibrithe eastóscadh aigéid núicléacha.

Tá taithí shaibhir againn in eastóscadh agus íonú aigéad núicléasach, íonú próitéine, scaradh cille, ceimileacanacht, agus réimsí teicniúla eile.

Úsáidtear ár gcuid táirgí go forleathan i go leor réimsí, mar thástáil leighis, tástáil ghéiniteach, taighde ollscoile, pórú géiniteach, agus mar sin de. Ní chuirimid ar fáil ach táirgí ach freisin is féidir tabhairt faoi OEM, ODM, agus riachtanais eile. Má tá riachtanas gaolmhar agat, bíodh leisce ort teagmháil a dhéanamh linn .