Mengapa RNA Lebih Mudah Terdegradasi Dibandingkan DNA Selama Ekstraksi Asam Nukleat?

Alasan mengapa RNA (asam ribonukleat) lebih mudah terdegradasi dibandingkan DNA (asam deoksiribonukleat) selama ekstraksi terutama terkait dengan struktur kimianya yang berbeda dan pengoperasian yang tidak tepat selama ekstraksi.

SAYA. Perbedaan struktur kimia:

1. RNA adalah struktur beruntai tunggal, yang lebih tidak stabil dibandingkan struktur untai ganda DNA.

2. Hidroksil di 2′ posisi: Ribosa dalam molekul RNA mengandung gugus hidroksil (-OH) di 2′ posisi, sedangkan deoksiribosa dalam DNA memiliki atom hidrogen pada posisi ini. Gugus hidroksil ekstra ini membuat molekul RNA lebih tidak stabil karena dapat mendorong reaksi hidrolisis spontan, mengakibatkan putusnya rantai RNA.

II. Pengaruh RNAse dalam sistem ekstraksi:

1. RNAse endogen: Itu ada di dalam sel dan dapat terus mendegradasi RNA bahkan setelah sel lisis.

2. RNAse eksogen: Ini banyak terdapat di lingkungan, seperti udara, kulit, dan perlengkapan laboratorium (sarung tangan, tabung reaksi, dll.).

AKU AKU AKU. Operasi eksperimental yang tidak tepat:

1. Reagen dan instrumen yang digunakan belum diberi perlakuan DEPC (dietilpirokarbonat) dan tidak dapat secara efektif menonaktifkan enzim RNA.

2. Inhibitor tidak efektif, atau dosisnya tidak mencukupi, dan aktivitas enzim RNA tidak dapat dihambat secara efektif.

3. Sampel eksperimental yang lebih banyak atau suhu homogenisasi yang lebih tinggi menyebabkan peningkatan aktivitas enzim RNA.

4. Perubahan pH dan suhu, terutama pada kondisi basa, dapat dengan mudah menyebabkan basa RNA terdeaminasi, mengakibatkan putusnya rantai; suhu tinggi juga dapat menyebabkan degradasi sebagian atau seluruh molekul RNA.

IV. Apa yang harus dilakukan untuk mengurangi degradasi RNA？

Untuk mengurangi degradasi RNA selama ekstraksi, serangkaian tindakan perlu diambil, termasuk menggunakan perlengkapan laboratorium bebas RNAse, beroperasi pada suhu rendah, menggunakan penstabil RNA, menggunakan kit yang sudah jadi, dll.. Metode ini secara efektif mengurangi risiko degradasi RNA dan memastikan sampel RNA berkualitas tinggi diperoleh untuk analisis hilir.

Pengenalan Pemasok

Shanghai Lingjun Bioteknologi Co., Ltd.didirikan pada 2016 yang merupakan produsen profesional bahan biomagnetik dan reagen ekstraksi asam nukleat.

Kami memiliki pengalaman yang kaya dalam ekstraksi dan pemurnian asam nukleat, pemurnian protein, pemisahan sel, chemiluminescence dan bidang teknis lainnya.

Produk kami banyak digunakan di berbagai bidang, misalnya tes kesehatan, pengujian genetik, penelitian universitas, pemuliaan genetik, dan sebagainya. Kami tidak hanya menyediakan produk tetapi juga dapat melakukan OEM, ODM, dan kebutuhan lainnya. Jika Anda memiliki kebutuhan terkait, jangan ragu untuk menghubungi kami di penjualan01@lingjunbio.com.