Mengapa RNA Lebih Mudah Didegradasi daripada DNA Semasa Pengekstrakan Asid Nukleik?

Sebab mengapa RNA (asid ribonukleik) lebih mudah terdegradasi daripada DNA (asid deoksiribonukleik) semasa perahan terutamanya berkaitan dengan struktur kimia yang berbeza dan operasi yang tidak betul semasa pengekstrakan.

saya. Perbezaan dalam struktur kimia:

1. RNA ialah struktur beruntai tunggal, yang lebih tidak stabil daripada struktur DNA untai dua.

2. Hidroksil pada 2′ kedudukan: Ribosa dalam molekul RNA mengandungi kumpulan hidroksil (-OH) pada 2′ kedudukan, manakala deoksiribosa dalam DNA mempunyai atom hidrogen pada kedudukan ini. Kumpulan hidroksil tambahan ini menjadikan molekul RNA lebih tidak stabil kerana ia boleh menggalakkan tindak balas hidrolisis spontan, mengakibatkan rantai RNA terputus.

II. Pengaruh RNAse dalam sistem pengekstrakan:

1. RNAse endogen: Ia wujud dalam sel dan boleh terus merendahkan RNA walaupun selepas lisis sel.

2. RNAse eksogen: Ia terdapat secara meluas dalam persekitaran, seperti udara, kulit, dan bekalan makmal (sarung tangan, tabung uji, dll.).

III. Operasi eksperimen yang tidak betul:

1. Reagen dan instrumen yang digunakan belum dirawat dengan DEPC (dietilpirokarbonat) dan tidak boleh menyahaktifkan enzim RNA dengan berkesan.

2. Inhibitor tidak berkesan, atau dos tidak mencukupi, dan aktiviti enzim RNA tidak boleh dihalang dengan berkesan.

3. Lebih banyak sampel eksperimen atau suhu homogenisasi yang lebih tinggi membawa kepada peningkatan aktiviti enzim RNA.

4. Perubahan pH dan suhu, terutamanya dalam keadaan alkali, boleh menyebabkan asas RNA deaminasi dengan mudah, mengakibatkan rantai putus; suhu tinggi juga boleh menyebabkan degradasi separa atau lengkap molekul RNA.

IV. Apakah yang perlu dilakukan untuk mengurangkan degradasi RNA？

Untuk mengurangkan degradasi RNA semasa pengekstrakan, beberapa siri langkah perlu diambil, termasuk menggunakan bekalan makmal bebas RNAse, beroperasi pada suhu rendah, menggunakan penstabil RNA, menggunakan kit siap, dll. Kaedah ini berkesan mengurangkan risiko kemerosotan RNA dan memastikan sampel RNA berkualiti tinggi diperoleh untuk analisis hiliran.

Pengenalan Pembekal

Shanghai Lingjun Biotechnology Co., Ltd.ditubuhkan pada 2016 yang merupakan pengilang profesional bahan biomagnet dan reagen pengekstrakan asid nukleik.

Kami mempunyai pengalaman yang kaya dalam pengekstrakan dan penulenan asid nukleik, penulenan protein, pemisahan sel, chemiluminescence dan bidang teknikal lain.

Produk kami digunakan secara meluas dalam pelbagai bidang, seperti ujian perubatan, ujian genetik, penyelidikan universiti, pembiakan genetik, dan seterusnya. Kami bukan sahaja menyediakan produk tetapi juga boleh menjalankan OEM, ODM, dan keperluan lain. Jika anda mempunyai keperluan yang berkaitan, sila hubungi kami di sales01@lingjunbio.com.