Hvad er fordelene ved magnetisk perlemetode til RNA-ekstraktion sammenlignet med Trizol-metoden?

1.For at forstå forskellene mellem de to metoder, det er vigtigt først at forstå deres principper:

 Trizol-metoden involverer brug af organiske opløsningsmidler som phenol og chloroform til at lysere celler, derved adskiller RNA fra DNA og proteiner. RNA opløses i den vandige fase og renses efter udfældning med isopropanol. Den magnetiske perlemetode frigiver RNA gennem lyseringsopløsningen, hvor silicamatrixen eller specifikke funktionelle grupper på de magnetiske perler specifikt adsorberer RNA i et miljø med højt saltindhold. Efter vask, RNA elueres i en opløsning med lavt saltindhold.

• Desuden, der er nogle forskelle i operationsprocessen for de to:

Trin	Magnetisk perlemetode	Trizol metode
Lysis	Hurtig lysis af lysat (automatiseret)	Manuel slibning/pulverisering + Trizol lysis
Adskille	Magnetiske perler adsorberede RNA og magnetisk rammeadskillelse	Centrifugal lagdeling (vandig/organisk fase)
Vask	De magnetiske perler blev vasket med ethanol/høj saltbuffer	75% ethanol blev brugt til at rense bundfaldet
Genvinde	Lav salt buffer eluering	Isopropanol udfældning + lufttørring
Tid	40-60 minutter (fuldautomatisk)	40-60 minutter (fuldautomatisk)

• Kvalitetsforskellen på RNA ekstraheret ved de to metoder:

 Renhed:

Trizol metode: OD260/280≈1,8-2,0, som let påvirkes af phenolrester eller proteinforurening.

Magnetisk perlemetode: højere renhed (OD260/280 er ofte>1.9), med mindre rester af urenheder.、

Sag: En kunde brugte Trizol-metoden og magnetisk perlemetode til manuelt at ekstrahere celle-RNA fra adhærente celler neuro2A.

Før ekstrahering af celle-RNA, komponenterne blev talt for at reducere fejl, og resultaterne er som følger

Prøve	Celleantal
1-1	4.11E6
2-1	5.93E6
3-1	6.98E5
1-2	4.35E6
2-2	5.72E6
3-2	6.82E5

Derefter blev Trizol-metoden og magnetisk perlemetode brugt til at udtrække prøverne manuelt, og resultaterne er som følger

Prøve	Metode	A260/A280	A260/A230	Konc.(af/uL)	EB	Udbytte(ug）
1-1	Mag-perler	2.093	2.222	2742.5	50uL	137.125
2-1		2.072	2.080	2835.4		141.77
3-1		2.038	2.001	470.08		23.504
1-2	Trizol	1.792	0.587	331.68	100uL	33.168
2-2		1.728	0.655	374.68		37.468
3-2		1.650	0.618	107.72		10.772

Med hensyn til udbytte, den magnetiske perlemetode overgår markant Trizol-metoden på tværs af alle prøver, især i prøver 1 og 2, hvor udbyttet overstiger 100 ug, sammenlignet med 30-40 ug for Trizol-metoden. Dette indikerer, at den magnetiske perlemetode tilbyder højere ekstraktionseffektivitet.

Med hensyn til renhed, A260/A280- og A260/A230-værdierne for RNA'et ekstraheret ved den magnetiske perlemetode er begge ovenfor 2, opfylder RNA-standarder af høj kvalitet. I modsætning hertil, Trizol-metoden giver RNA med lavere renhed, med A260/A280 værdier fra 1.6 til 1.7, indikerer ufuldstændig proteinfjernelse. Derudover, A260/A230-værdierne er nedenfor 0.7, antyder mulige resterende organiske eller saltforbindelser.

 Samlet set, den magnetiske perlemetode udmærker sig i dette eksperiment, giver højt udbytte, høj renhed, og nem betjening, hvilket gør den overlegen i forhold til den traditionelle Trizol-metode og ideel til downstream-eksperimenter, der kræver høj kvalitet. Det ekstraherede RNA vil blive brugt i qPCR-eksperimenter til at undersøge ændringer i genekspression.

 Desuden, den magnetiske perlemetode giver yderligere fordele, såsom automatisering til high-throughput prøver (som 96-brønds plader), blod, spyt, og andre letforarbejdede prøver, og stærk kompatibilitet, hvilket gør det særligt velegnet til klinisk eller storstilet screening.

Oversigt: Vælg Trizol-metoden, når du har at gøre med komplekse prøver (såsom væv rigt på polysaccharider og polyphenoler) og når budgetbegrænsninger er et problem. Vælg den magnetiske perlemetode for høj gennemstrømning, automatiseret, og hurtig udvinding, eller når der fokuseres på renhed og sikkerhed (såsom i klinisk diagnostik). Trend: På grund af dens høje standardisering, den magnetiske perlemetode bliver stadig mere populær, især inden for præcisionsmedicin.

Lnjnbio Universal lille RNA-ekstraktionsreagens (magnetisk perlemetode)

Leverandør

Shanghai Lingjun Biotechnology Co., Ltd.blev etableret i 2016 som er en professionel producent af biomagnetiske materialer og nukleinsyreekstraktionsreagenser.

Vi har stor erfaring med udvinding og oprensning af nukleinsyre, proteinoprensning, celleadskillelse, kemiluminescens, og andre tekniske områder.

Vores produkter er meget udbredt inden for mange områder, såsom medicinsk test, genetisk testning, universitetsforskning, genetisk avl, og så videre. Vi leverer ikke kun produkter, men kan også påtage os OEM, ODM, og andre behov. Hvis du har et relateret behov, er du velkommen til at kontakte os .