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Como fornecer soluções eficientes para classificação de fragmentos de DNA?

Atualmente, muitos problemas na pesquisa de biologia molecular exigem a classificação do DNA de acordo com o tamanho, que é conhecido como classificação de fragmentos. A eletroforese em gel de agarose permite a separação do DNA na faixa de 10 5~centenas de pares de bases. Em contraste, eletroforese em gel de acrilamida permite a separação de DNA na faixa de milhares de pares de bases. Para obter alta resolução nesses processos de separação, a diferença de tamanho para separar dois fragmentos deve ser 10% e um teor de ácido nucleico de até 5 para 10 miligramas.

Classificação de fragmentos de DNA
Classificação de fragmentos de DNA

O método de precipitação seletiva, uma combinação de polietilenoglicol e esferas magnéticas biológicas, destaca-se como uma abordagem mais eficiente e conveniente para classificação de fragmentos. Em altas concentrações de soluções de PEG e NaCl, PEG perturba a camada de hidratação fora das moléculas de DNA, fazendo com que eles se agreguem e precipitem. Isso expõe os grupos fosfato carregados negativamente, que então formam uma 'ponte salina’ com os grupos carboxila nas esferas magnéticas’ superfície, permitindo que o DNA seja adsorvido nas contas.

Quanto mais tempo o DNA, quanto mais grupos fosfato carregados negativamente estão expostos na superfície, tornando toda a molécula mais carregada negativamente e mais fácil de adsorver em esferas magnéticas, e pode ser recuperado com concentrações mais baixas de PEG e NaCl. Quanto mais curto o DNA, quanto maior a concentração de PEG e NaCl necessária para quebrar completamente a camada de hidratação em sua superfície, expondo grupos fosfato com carga negativa suficientes para serem adsorvidos por esferas magnéticas e depois recuperados. Se você deseja recuperar fragmentos de DNA mais curtos, você precisa adicionar um volume maior de contas magnéticas. A proporção entre a suspensão de esferas magnéticas e a amostra também afeta o tamanho da triagem de fragmentos. À medida que o aumento da concentração da suspensão de esferas magnéticas, as esferas magnéticas aumentarão sua capacidade de adsorção para fragmentos pequenos, além de fragmentos grandes.

Quando um comprimento específico de fragmento de DNA deve ser separado por esferas magnéticas, duas rodadas de classificação são normalmente realizadas. Na primeira rodada, as esferas magnéticas se ligam ao DNA com maior peso molecular, que é então removido descartando as contas. A segunda rodada envolve o produto restante, onde as esferas magnéticas se ligam ao DNA com maior peso molecular e removem o DNA com menor peso molecular descartando o sobrenadante.

Ambos DNA de fita dupla, ADN de cadeia simples, e o RNA podem dissociar grupos fosfato carregados negativamente em solução para que possam ser purificados e recuperados com esferas magnéticas. No entanto, DNA e RNA de fita simples não podem ser rastreados quanto ao tamanho do fragmento. A estrutura secundária do DNA de fita dupla é geralmente uma molécula linear de dupla hélice relativamente estável.. Na presença de PEG, o número de grupos fosfato carregados negativamente dissociados está positivamente correlacionado com o seu comprimento. No entanto, RNA e DNA de fita simples têm estruturas secundárias complexas, que evitam que os grupos negativos expostos sejam positivamente correlacionados com o comprimento, tornando impossível rastrear fragmentos como DNA. Além disso, devido à estabilidade variável de DNA e RNA em diferentes valores de pH, o pH dos tampões usados ​​para purificar DNA e RNA são diferentes porque DNA e RNA têm estabilidade diferente sob diferentes condições de pH.

As esferas magnéticas de classificação de fragmentos da Shanghai Lingjun Biotechnology são desenvolvidas e produzidas de forma independente, desde matérias-primas até esferas magnéticas acabadas, with strict quality control to ensure that the performance and consistency of the final product meet high standards and ensure a stable supply of the product. The company continuously invests in research and development, always maintaining an absolute emphasis on product quality, customer satisfaction, and market competitiveness.

DNA Extraction/Isolation Magnetic Beads reagent kit
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Introdução ao fornecedor

Xangai Lingjun Biotecnologia Co., Ltda.foi estabelecido em 2016 que é um fabricante profissional de materiais biomagnéticos e reagentes de extração de ácido nucleico.

Temos vasta experiência em extração e purificação de ácidos nucleicos, purificação de proteínas, separação celular, quimioluminescência e outros campos técnicos.

Nossos produtos são amplamente utilizados em muitos campos, como exames médicos, testes genéticos, pesquisa universitária, melhoramento genético, e assim por diante. Nós não apenas fornecemos produtos, mas também podemos realizar OEM, ODM, e outras necessidades. Se você tiver necessidades relacionadas, não hesite em contactar-nos em sales01@lingjunbio.com.

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