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Comment fournir des solutions efficaces pour le tri des fragments d'ADN?

À l'heure actuelle, de nombreux problèmes de recherche en biologie moléculaire nécessitent de classer l'ADN en fonction de sa taille, ce qu'on appelle le tri des fragments. L'électrophorèse sur gel d'agarose permet la séparation de l'ADN dans la gamme de 10 5~ des centaines de paires de bases. En revanche, l'électrophorèse sur gel d'acrylamide permet la séparation de l'ADN dans la gamme de milliers de paires de bases. Pour obtenir une haute résolution dans ces processus de séparation, la différence de taille pour séparer deux fragments doit être 10% et une teneur en acide nucléique allant jusqu'à 5 à 10 milligrammes.

Tri des fragments d'ADN
Tri des fragments d'ADN

La méthode de précipitation sélective, une combinaison de polyéthylène glycol et de billes magnétiques biologiques, se distingue comme une approche plus efficace et plus pratique du tri des fragments. Dans des concentrations élevées de solutions de PEG et NaCl, Le PEG perturbe la couche d'hydratation à l'extérieur des molécules d'ADN, les faisant s'agréger et précipiter. Cela expose les groupes phosphate chargés négativement, qui forment alors un « pont de sel »’ avec les groupes carboxyles sur les billes magnétiques’ surface, permettant à l'ADN d'être adsorbé sur les billes.

Plus l'ADN est long, plus les groupes phosphate chargés négativement sont exposés à la surface, rendant la molécule entière plus chargée négativement et plus facile à adsorber sur les billes magnétiques, et il peut être récupéré avec des concentrations plus faibles de PEG et de NaCl. Plus l'ADN est court, plus la concentration de PEG et de NaCl nécessaire pour décomposer complètement la couche d'hydratation à sa surface est élevée, exposer suffisamment de groupes phosphate chargés négativement pour être adsorbés par des billes magnétiques puis récupérés. Si vous souhaitez récupérer des fragments d'ADN plus courts, vous devez ajouter un plus grand volume de billes magnétiques. Le rapport entre la suspension de billes magnétiques et l'échantillon affecte également la taille des fragments examinés.. À mesure que la concentration de suspension de billes magnétiques augmente, les billes magnétiques augmenteront leur capacité d'adsorption pour les petits fragments en plus des gros fragments.

Lorsqu'une longueur spécifique de fragment d'ADN doit être séparée par des billes magnétiques, deux tours de tri sont généralement effectués. Au premier tour, les billes magnétiques se lient à l'ADN de poids moléculaire plus élevé, qui est ensuite retiré en jetant les perles. Le deuxième tour concerne le produit restant, où les billes magnétiques se lient à l'ADN de poids moléculaire plus élevé et éliminent l'ADN de poids moléculaire inférieur en éliminant le surnageant.

Les deux ADN double brin, ADN simple brin, et l'ARN peut dissocier les groupes phosphate chargés négativement en solution afin qu'ils puissent être purifiés et récupérés avec des billes magnétiques. Cependant, L’ADN et l’ARN simple brin ne peuvent pas être analysés pour déterminer la taille des fragments. La structure secondaire de l’ADN double brin est généralement une molécule linéaire à double hélice relativement stable.. En présence de PEG, le nombre de groupes phosphate chargés négativement dissociés est positivement corrélé à sa longueur. Cependant, L'ARN et l'ADN simple brin ont des structures secondaires complexes, qui empêchent les groupes négatifs exposés d'être positivement corrélés à la longueur, rendant impossible le criblage de fragments comme l'ADN. En outre, en raison de la stabilité variable de l'ADN et de l'ARN à différentes valeurs de pH, le pH des tampons utilisés pour purifier l'ADN et l'ARN est différent car l'ADN et l'ARN ont une stabilité différente dans des conditions de pH différentes.

Les billes magnétiques de tri de fragments de Shanghai Lingjun Biotechnology sont développées et produites indépendamment à partir des matières premières jusqu'aux billes magnétiques finies., avec un contrôle de qualité strict pour garantir que les performances et la cohérence du produit final répondent à des normes élevées et garantissent un approvisionnement stable du produit. L'entreprise investit continuellement dans la recherche et le développement, en gardant toujours un accent absolu sur la qualité du produit, satisfaction du client, et la compétitivité du marché.

Kit de réactifs pour extraction/isolation d'ADN avec billes magnétiques
Kit de billes magnétiques/réactifs pour extraction/isolement d'ADN

Présentation du fournisseur

Société de biotechnologie Shanghai Lingjun., Ltd.a été établi en 2016 qui est un fabricant professionnel de matériaux biomagnétiques et de réactifs d'extraction d'acide nucléique.

Nous avons une riche expérience dans l'extraction et la purification des acides nucléiques, purification des protéines, séparation cellulaire, chimiluminescence et autres domaines techniques.

Nos produits sont largement utilisés dans de nombreux domaines, comme les tests médicaux, tests génétiques, recherche universitaire, sélection génétique, et ainsi de suite. Nous fournissons non seulement des produits, mais pouvons également entreprendre des OEM, ODM, et autres besoins. Si vous avez des besoins connexes, n'hésitez pas à nous contacter au sales01@lingjunbio.com.

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