Hvordan tilby effektive løsninger for sortering av DNA-fragmenter?

For tiden, mange problemer innen molekylærbiologisk forskning krever gradering av DNA etter størrelse, som er kjent som fragmentsortering. Elektroforese på agarosegel tillater separasjon av DNA i området 10 ⁵~hundrevis av basepar. I kontrast, elektroforese på akrylamidgel tillater separasjon av DNA i området tusenvis av basepar. For å oppnå høy oppløsning i disse separasjonsprosessene, størrelsesforskjellen for å skille to fragmenter bør være 10% og et nukleinsyreinnhold på opptil 5 til 10 milligram.

Den selektive nedbørsmetoden, en kombinasjon av polyetylenglykol og biologiske magnetiske perler, skiller seg ut som en mer effektiv og praktisk tilnærming til fragmentsortering. I høye konsentrasjoner av PEG- og NaCl-løsninger, PEG forstyrrer hydreringslaget utenfor DNA-molekylene, får dem til å aggregere og utfelles. Dette eksponerer de negativt ladede fosfatgruppene, som deretter danner en "saltbro".’ med karboksylgruppene på de magnetiske kulene’ flate, slik at DNA kan adsorberes på kulene.

Jo lengre DNA, de mer negativt ladede fosfatgruppene er eksponert på overflaten, gjør hele molekylet mer negativt ladet og lettere å adsorbere på magnetiske perler, og det kan gjenvinnes med lavere konsentrasjoner av PEG og NaCl. Jo kortere DNA, jo høyere konsentrasjon av PEG og NaCl som trengs for å bryte ned hydreringslaget på overflaten grundig, eksponere nok negativt ladede fosfatgrupper til å bli adsorbert av magnetiske perler og deretter gjenvunnet. Hvis du ønsker å gjenopprette kortere DNA-fragmenter, du må legge til et større volum av magnetiske perler. Forholdet mellom magnetisk perlesuspensjon og prøven påvirker også størrelsen på screening av fragmenter. Som en økning av konsentrasjonen av magnetisk perlesuspensjon, de magnetiske kulene vil øke sin adsorpsjonskapasitet for små fragmenter i tillegg til store fragmenter.

Når en bestemt lengde av DNA-fragmentet skal separeres med magnetiske perler, Det utføres vanligvis to runder med sortering. I første runde, de magnetiske kulene binder seg til DNA med høyere molekylvekt, som deretter fjernes ved å kaste perlene. Den andre runden involverer det gjenværende produktet, hvor de magnetiske kulene binder seg til DNA med høyere molekylvekt og fjerner DNA med lavere molekylvekt ved å kaste supernatanten.

Begge dobbelttrådet DNA, enkelttrådet DNA, og RNA kan dissosiere negativt ladede fosfatgrupper i løsning slik at de kan renses og gjenvinnes med magnetiske perler. Imidlertid, enkelttrådet DNA og RNA kan ikke screenes for fragmentstørrelse. Den sekundære strukturen til dobbelttrådet DNA er generelt et relativt stabilt lineært dobbelthelix-molekyl. I nærvær av PEG, antall negativt ladede fosfatgrupper dissosiert er positivt korrelert med lengden. Imidlertid, RNA og enkelttrådet DNA har komplekse sekundære strukturer, som forhindrer at de eksponerte negative gruppene blir positivt korrelert med lengden, gjør det umulig å screene fragmenter som DNA. I tillegg, på grunn av den varierende stabiliteten til DNA og RNA ved forskjellige pH-verdier, pH-verdien til bufferene som brukes til å rense DNA og RNA er forskjellig fordi DNA og RNA har ulik stabilitet under forskjellige pH-forhold.

Shanghai Lingjun Bioteknologi fragment sorterende magnetiske perler er uavhengig utviklet og produsert fra råvarer til ferdige magnetiske perler, med streng kvalitetskontroll for å sikre at ytelsen og konsistensen til sluttproduktet oppfyller høye standarder og sikre en stabil forsyning av produktet. Selskapet investerer kontinuerlig i forskning og utvikling, alltid opprettholde en absolutt vekt på produktkvalitet, kundetilfredshet, og markedskonkurranseevne.

Leverandørintroduksjon

Shanghai Lingjun Biotechnology Co., Ltd.ble etablert i 2016 som er en profesjonell produsent av biomagnetiske materialer og nukleinsyreekstraksjonsreagenser.

Vi har rik erfaring innen utvinning og rensing av nukleinsyre, proteinrensing, celleseparasjon, kjemiluminescens og andre tekniske felt.

Våre produkter er mye brukt på mange felt, som medisinsk testing, genetisk testing, universitetsforskning, genetisk avl, og så videre. Vi leverer ikke bare produkter, men kan også påta oss OEM, ODM, og andre behov. Hvis du har relaterte behov, ta gjerne kontakt med oss ​​på sales01@lingjunbio.com.